異なるマウス免疫系細胞の遺伝子発現レベルを探索します。検索バーに遺伝子名(またはエイリアス)を入力することから始めて、スワイプできるヒットのリストを表示します。これは、その遺伝子の高温または寒さの発現が異なる免疫系細胞系統(B細胞、T細胞、骨髄細胞など)にどれほど高温または低いことを示しています。2つの異なるプラットフォームで生成されたデータセットを切り替えます:rnaseqとマイクロアレイ。
セル系統アイコンを押して、バーチャートとして視覚化された同じ式データを確認します。右上の設定メニューを使用して、ログと線形軸を切り替えます。マイクロアレイデータでは、低発現値が部分的に閉塞されます。画面、代わりに「関連する遺伝子を表示する」を押すと、quot;ボタン、あなたは' ll" gene Constellation"見る。これは、特定の集団グループ内で最も相関した遺伝子を示しています。デフォルトでは、主要な集団に関して相関が示されています。これらは免疫システム全体にわたる主要な集団です。
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データは、国立衛生研究所(NIAID)がサポートする国際コンソーシアムである免疫学的ゲノムプロジェクトによって生成されます。
- New RNAseq cell types
- Updated RNAseq data