بالنسبة للجزء الأكبر، فإن اللعب في العوالم السبع الشاملة هي توازن العمل وحل الألغاز يدور حول مهارات أشكال معركة قوة بن الغريبة. قد يحتاج بن إلى التغيير إلى شكله Humungousaur في اختراق الأبواب، أو استخدام شكل مستنقعاته لإشعال المواد القابلة للاشتعال. يحتوي كل نموذج على مجموعات مختلفة وهجمات خاصة يمكنها تنفيذها، ويمكن بن فتح قدرات جديدة من خلال هزيمة الأعداء وجمع طاقة متوهجة.
، ومع ذلك، هناك عنصر طريقة لعب واحد يجب أن يكون اللاعبون على دراية: استخدام قدرات النموذج الفطرية يستنزف الطاقة من Meter Ben's Omnitrix، ومنعها من استخدامها باستمرار حتى يتم إعادة شحن العداد. نتيجة لذلك، سيحتاج اللاعبون إلى التركيز على المجموعات وإنقاذ هجماتهم الخاصة لتشطيب الضربات بدلا من استخدامها باستمرار في المعركة.
تبدأ القصة باسم Vilgax غزوات Bellwood مع جهاز عرض غي باطل Null Gigantic مئات من السجناء الفارغة في المدينة. بن محاولات تحويلها إلى Alien X، لكن البروفيسور بارادوكس يمنعه، تفيد بأن الآن ليس الوقت المناسب لاستخدام الغريبة X. بدلا من ذلك، فإنهم ينفصلون لمعالجة الغزو. بن يحارب طريقه إلى Psyphon (من ينسق الهجوم من المستوى الأرضي)، ولكن عندما يهزم بن Psyphon، إلا أنه يجلب حياة السيد عصير العلاج كهلل.
بن يهزم السيد عصير ضربها مع كل أجنبي في ترسانةه، باستثناء المدفع والغريبة X، وفي هذه العملية يضع OMNITRIX في وضع إعادة التشغيل ويغفل معظم أرسناله. يظهر Ammuth على كتف بن ويفحص Omnitrix، قائلا إنه يحتاج إلى إعادة الشحن قبل أن يستطيع بن الوصول إلى جميع الأجانب مرة أخرى. لتقديم المسائل أسوأ من ذلك، يعلم Paradox البروفسور الفريق أن Vilgax قد استولت على الأرض بنجاح، لذلك يرسلهم بعيدا بما فيه الكفاية في الوقت المناسب لتدمير كل مصدر طاقة لجهاز العرض الفاخطى باطل ممكن في المجرة بأكملها، تذكر أن الأول يجري المعاد تدويرها من النفايات المشعة السمية من الفليبين: كوكب Wildmutt's Homeet، ومع ذلك، تتوفر فقط Spidermonkey، البرد الكبير، Humungousaur، Swampfire، و Cannonbolt. (فقط Swampfire و Goop متوفرة في إصدار DS).
الوصول إلى Vurpin، Ben Orders Gwen، Kevin، والسفينة للبقاء، لأنه إذا وصل Vilgax، فسوف يأخذ كل منهم مجتمعون امسكه يحارب بن طريقه في جميع أنحاء المصفاة، وتذهب عبر Bioids Vilgax، Vulpimancer المحلي، ثعبان عملاق برأسين. ثم يجد Ben Brothers Brothers (DarkStar يحل محل الإخوة في الإصدار DS) وتمكن من هزيمةهم. بعد ذلك، يجد بن رسالة نصية نصية من ماكس، تفيد بأن بن واحد دمر ليس هو الوحيد الذي يستجيب فيه هو في طريقه حاليا إلى Terradino: Kideet Humungousour Home Planet، لتدمير الطاقة الأساسية هناك. ثم يتم فتح Goop.